Vedci objavili v genóme ošípaných rodinu jedinečných krátkych opakovaní, ktoré majú evolučnú podobnosť s podobnými opakovaniami u primátov.
Na projekte sa zúčastnili vedci z Jilin University (Changchun, Čína) a Akadémie poľnohospodárskych vied (Heilongjiang, Čína) v spolupráci so spoločnosťou Firefly BioWorks Corporation (USA).
Po analýze štruktúry a pôvodu PRE-1 (prasací opakujúci sa prvok, doslova - „prasací opakujúci sa prvok“) dospeli k záveru, že najbližšími príbuznými primátov na bývalej superkontinente Laurasia môžu byť prasatá. Predbežná tlač bola zverejnená na serveri bioRxiv 31. augusta 2015.
Študovaný CDP (krátke rozptýlené opakovanie) PRE-1 sa nachádza v intergénnej oblasti, približne 686 - 985 párov báz pred začiatkom génu kódujúceho proteín viažuci inzulínový rastový faktor (IGFBP7). Opakovaná sekvencia PRE-1 299 párov báz sa porovnala s 40 rôznymi opakovaniami primátov Alu a významné podobnosti sa našli tak v samotných sekvenciách, ako aj v obrazci distribúcie ich repetícií cez chromozómy.
Predikovaná sekundárna štruktúra RNA sa opakuje PRE-1 zložená do modelu podobného Alu-opakovaniam. Nakoniec spoločný pôvod PRE-1 a Alu z takzvanej 7SL RNA (RNA rozpoznávajúca signál) naznačuje ich evolučnú podobnosť a prisudzuje sa ošípané rodine, ktorá zahŕňa hlavne primáty.
Predtým sa vedci pri budovaní fylogenetických stromov spoliehali iba na podobnosti a rozdiely génov, pričom ignorovali skutočnosť, že v priebehu evolúcie prešiel celý genóm zmenami vrátane tých prvkov, ktoré nekódujú proteíny alebo RNA a ktorých význam je pre vedcov stále nejasný.
Propagačné video:
Táto štúdia založená na integrovanom prístupe k analýze intergénnych prvkov poskytuje podľa autorov „veľmi presvedčivé“fakty, z ktorých možno vyvodiť evolučné závery. Konkrétne podľa týchto výsledkov sa odhadovaná doba divergencie druhov posúva z pred 65 na 80-100 miliónov rokov.