Medzinárodný tím vedcov identifikoval genetické mechanizmy vývoja prežúvavcov z jeleňov na hovädzí dobytok tak, že identifikoval zmeny usporiadania hotspotov chromozómov. Článok o tom bol uverejnený v časopise Genome Research, ktorý patrí do prvého kvartilu.
Táto metóda umožnila zistiť, ako sa chromozomálna prestavba uskutočnila u prežúvavcov - inými slovami, ako sa gény zmenili v horúcich miestach (je to názov oblastí chromozómov, ktoré sa počas evolúcie prechádzajú transformáciou, na rozdiel od chladných miest, ktoré udržujú neporušené génové bloky). Ukázalo sa, že tieto zmeny majú vplyv na reguláciu celých skupín fyziologicky dôležitých génov, najmä tých, ktoré sú zodpovedné za trávenie, čo je charakteristické pre celé podskupine prežúvavcov, ktoré patria do radu artiodaktylov, a odlišuje ich od ostatných zvierat.
„Prežúvavce majú komplexný tráviaci systém, ktorý sa tak stal v procese evolúcie. Je známe, že predkovia všetkých cicavcov sú hmyzožravci, ktorí majú s dravcami veľa spoločného. Prakticky nejedia jedlo, trávia veľmi rýchlo, takže musia často jesť. U prežúvavcov je proces trávenia oveľa dlhší, žalúdok sa skladá zo štyroch častí a trávenie sa uskutočňuje v štyroch fázach. Pravdepodobne však prežúvavce raz zjedli „čo beží“. A dnes žije v juhovýchodnej Ázii jeleň - najmenší a najstarší prežúvavec na svete - jesť kraby a myši. V správach, ktoré vyšli nedávno, bol pižmový jeleň považovaný za predátorov, ale napriek prítomnosti kly sa živí výlučne rastlinnými potravinami, najmä listami a machom, “hovorí spoluautor článku. Vedúci vedeckého smeru Ústavu molekulárnej a bunkovej biológie SB RAS, doktor biologických vied Alexander Sergeevich Grafodatsky. Pod jeho vedením sa takmer pred 40 rokmi začali študovať genómy artiodaktylov v Novosibirskom Academgorodoku.
Dnes sa metóda chromozómovej maľby (ZooFISH) používa na štúdium genómov na IMKB SB RAS. Toto meno dostala kvôli tomu, že chromozómy sú zafarbené fluórchrómami - farbivami, ktoré môžu žiariť v ultrafialovom alebo modrom svetle. Toto sa robí za účelom porovnania chromozómových oblastí v rôznych druhoch a určenia, ktoré z nich zostali nezmenené v procese evolúcie a ktoré prešli zmenou usporiadania. Táto metóda v kombinácii so sekvenčnými a bioinformatickými údajmi získanými v zahraničí umožnila s veľkou presnosťou určiť chromozomálne prestavby najdôležitejšie pre vývoj zástupcov veľrýb, ktoré zahŕňajú prežúvavce. Preskúmali sa chromozómy alpaky, šedej veľryby, jeleňa jávskeho, sibírskeho pižma, žirafy, daňka, sibírskeho srnca, čiernu antilopu, pižmoň a kravu.
„Dostali sme mimoriadne zaujímavé výsledky, mnohé z nich stále čakajú na potvrdenie, najmä existuje dôvod sa domnievať, že rovnaké chromozomálne prestavby, ktoré sú zodpovedné za zmeny v type trávenia, sú tiež spojené s charakteristikami pôrodu,“poznamenáva Alexander Grafodatsky.