Bakteriofágy bez obsahu Tailless sa nedali zistiť štandardnými metódami - vedci sa však teraz domnievajú, že dominujú svetovým oceánom.
Každá kvapka vody, ktorá nie je príliš hlboká od hladiny mora, obsahuje asi 10 miliónov vírusov. Nie je prekvapujúce, že biológovia neustále objavujú nových, hoci objav celej novej skupiny je stále veľmi zriedkavý. Zdá sa, že štandardné techniky jednoducho neumožnili, aby si ich všimli, hoci sa ukázalo, že takéto vírusy sú veľmi početné - možno sú rozšírené nielen v oceáne a jednoducho unikajú vedcom.
Martin Polz z Massachusettsovho technologického inštitútu a jeho kolegovia skúmali vzorky vody odobraté pri severoamerickom pobreží Atlantického oceánu. Hľadali vírusy obsahujúce dvojvláknovú DNA - také vírusy sú veľmi rozšírené vrátane herpesu a bakteriofága T4 (Caudovirales), ktorý pozná každý zo školy. Infikovanie kultúr morských baktérií Vibrionaceae vedci objavili 200 rôznych vírusov DNA, z ktorých 18 bolo pripísaných novému radu Autolykiviridae. O tom píšu v článku publikovanom v časopise Nature.
Názov skupiny sa týka hrdinu gréckej mytológie Autolycus, mazaného zlodeja, ktorého chytanie je také ťažké ako tieto vírusy. "Najbežnejšie vírusy na Zemi sú baktérie infikujúce baktérie obsahujúce dvojvláknovú DNA," napísal Poltz a jeho spoluautori. „Caudoviraly s chvostovými vírusmi, ktoré dominujú v databázach a zbierkach plodín, však nepredstavujú ich prítomnosť v životnom prostredí. V skutočnosti vo vzorkách vody dominujú vírusy bez obsahu. ““
Bakteriálne bunky infikované Autolykiviridae / MIT Phages, Kauffman et al., 2018.
Bakteriofágy „Tailless“sa vyznačujú malou veľkosťou genómu - len asi 10 000 báz, 4-5 krát menej ako v príbuzných príbuzných. Ich schopnosť infikovať a usmrtiť bakteriálne bunky bola tiež neobvyklá. Ak obyčajné fágy v pokusoch spravidla ovplyvnili jeden konkrétny druh vibrácií, tieto sa infikovali v priemere štyri a viedli k výrazne vyššej smrti buniek. „Zistilo sa, že sú zodpovedné za 40 percent bakteriálnych úmrtí, hoci predstavovali asi 10 percent z celkového počtu vírusov vo vzorke,“vysvetľuje jeden z autorov diela.
Po obvode diagramu sa nachádzajú rôzne druhy vibrácií, ktoré sú s nimi spojené: vírusy, ktoré ich infikujú, sú spojené s modrými - chvostovými bakteriofágmi, oranžovými - „bez chvostov“Autolykiviridae / MIT, Kauffman et al., 2018.
Tieto čísla naznačujú veľkú úlohu, ktorú nová skupina Autolykiviridae hrá v regulácii bakteriálnych populácií a v biosfére ako celku. Vedci sú presvedčení, že ich technika pomôže nájsť vírusy, ktoré predtým unikli detekcii v pôde a možno v ľudskom čreve. Podobné genetické sekvencie sa skutočne nachádzajú v genómoch baktérií v ľudskej mikroflóre.
Propagačné video:
Sergey Vasiliev