Americkí vedci spolu s kolegami z Ruska potvrdili, že bakteriálny proteín, o ktorom sa predtým predpokladalo, že dokáže upravovať RNA (kyselinu ribonukleovú), sa v skutočnosti môže použiť ako nástroj na modifikáciu genómu, podobne ako v prípade technológie CRISPR / Cas9. Článok bol publikovaný v časopise Science.
Približne polovica všetkých baktérií má určitý druh imunitného systému, ktorý sa nazýva CRISPR / Cas9, ktorý ich chráni pred vírusmi. Systém pozostáva z génov, ktoré kódujú proteíny Cas, ktoré štiepia cudzie gény, ako aj z krátkych opakujúcich sa sekvencií DNA oddelených jedinečnými rezmi - spacermi. Rozpätia kódujú rôzne typy vodiacej RNA, molekuly, ktorá rozpoznáva špecifické vírusové génové sekvencie a usmerňuje Cas, aby ich zneškodnil.
Existuje mnoho typov CRISPR / Cas9, ktoré sa vyznačujú rôznymi proteínmi Cas9. Vedci predtým opísali proteín C2c2, ktorý neobsahuje oblasti, ktoré vykonávajú nukleázovú funkciu, inými slovami, rezanú DNA. Vedci navrhli, že proteín sa zameriava na RNA.
Rad experimentov preukázal, že C2c2 je skutočne schopný štiepiť jednovláknovú RNA. Táto schopnosť proteínu umožňuje použitie systému CRISPR na knockout - potlačenie funkcií - bakteriálnej messengerovej RNA, ktorá prenáša informácie z génov na ribozómy, kde sa bielkoviny syntetizujú na jej základe. Vedci testovali schopnosť C2c2 viazať sa na špecifické oblasti RNA z E. coli (Escherichia coli) a preukázali, že sa proteín nielen viaže na RNA, ale tiež narušuje jeho sekvenciu.
Podľa autorov diela s najväčšou pravdepodobnosťou existujú ďalšie systémy zamerané na RNA. V budúcnosti plánujú vedci vyvinúť prispôsobiteľné molekulárne nástroje na manipuláciu s vírusovou, bakteriálnou a dokonca aj ľudskou RNA.